בנגיף קורונה החדש מבחינים שני זנים
עודכן ב:17/03/2020
טאנג וחב' מסין, חקרו את המקור ואת האבולוציה של נגיף קורונה החדש SARS-CoV-2 ואת השוני בינו לבין נגיפי קורונה קרובים. החוקרים אמנם מצאו שונות של 4% בלבד ברצף הנוקלאוטידים בין הנגיף המגפתי לבין הנגיף הנפוץ בעטלפים (SARSr-CoV; RaTG13), אך ההבדלים שנמצאו באתרים נייטרליים של הגנום היו בסדר גודל של 17%, דבר המעיד על התפצלות גדולה יותר מזו שסברו תחילה.
ממצאי החוקרים מעידים כי השינויים באזורים של אתר הקשירה לקולטן (RBD ) של הספייקס בנגיף החדש ובנגיף הנפוץ בפנגולין (יונק אוכל נמלים המעורב בהתפרצות), נגרמו כנראה על ידי מוטציות וסלקציה טבעית בנוסף לרקומבינציה. בחינה של 103 גנומים מבידודי נגיף מהאוכלוסיה במחוז ווהאן, הוכיחה כי הנגיף התפצל לשני זנים S, L. הטיפוס L האחראי ל-70% מההדבקות, אך הטיפוס S היה זן המקור. החוקרים משערים כי ההתערבות במגיפה הפעילה לחץ סלקטיבי על הנגיף מטיפוס L, שהוא היותר אלים ומתפשט מהר יותר. מאידך, הטיפוס S הותיק יותר ופחות אלים, הגביר את תדירותו באוכלוסיה עקב לחץ סלקטיבי מתון יותר. הממצאים נאספו החל מהתפרצות המגיפה ועד סוף חודש פברואר 2020.
מקור
מקור: ד"ר איתן ישראלי, מומחה לבטיחות ביולוגית ויו"ר האגודה הישראלית לבטיחות ביולוגית.